Empieza a trabajar como fotoperiodista en 1994, en el diario local Cádiz Información. Más tarde se convierte en colaborador habitual de El País y de Agencia Efe en Málaga. En 2001 asume la corresponsalía fotográfica de la agencia Reuters para Andalucía Oriental y empieza a colaborar en diversas revistas extranjeras.
En 2006, Reuters le destina como corresponsal a Rabat. Desde allí cubre los acontecimientos sociales y políticos de todo el Magreb, incluidos Libia y Mauritania. A inicios de 2010 cambia este destino por Lisboa.
Marchante ha obtenido los premios Los Reporteros (1994) y el Premio Andalucía de Periodismo (2000) con un reportaje sobre los refugiados albanokosovares. Su exposición Mujeres entre dos fuegos, realizado en 2001 en Cisjordania y Gaza y editada por la Diputación de Cádiz, refleja la vida cotidiana de las mujeres palestinas. Además participa en la exposición colectiva Prohibido volar, elaborada por la ONG Save the Children en 2005.
Colaboraciones de Rafael Marchante: